Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smpd1Q04519 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms