Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CkbQ04447 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CkbQ04447 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms