Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms