Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx2Q03358 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms