Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfiaQ02780 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms