Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GscQ02591 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GscQ02591 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GscQ02591 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GscQ02591 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GscQ02591 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms