Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlh1Q02576 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms