Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp39Q02525 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms