Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms