Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms