Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms