Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gjb2Q00977 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjb2Q00977 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms