Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms