Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Polr2cP97760 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr2cP97760 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms