Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SgcdP82347 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SgcdP82347 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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