Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx1P81068 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx1P81068 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms