Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx3P81067 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx3P81067 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms