Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx2P81066 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms