Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otx2P80206 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms