Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9xP70398 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9xP70398 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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