Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SeboxP70368 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeboxP70368 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms