Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NficP70255 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NficP70255 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NficP70255 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NficP70255 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms