Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkcbP68404 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms