Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubb4bP68372 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms