Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl39P62892 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms