Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vsnl1P62761 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms