Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps6P62754 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6P62754 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms