Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou3f4P62515 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f4P62515 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms