Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpfP62307 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms