Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx1bP61264 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms