Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actr1aP61164 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actr1aP61164 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms