Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ube2d1P61080 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms