Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hps5P59438 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms