Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdrg1P59048 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdrg1P59048 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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