Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf2P58021 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm9sf2P58021 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms