Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms