Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn18P56857 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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