Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox17P56394 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms