Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab8aP55258 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab8aP55258 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms