Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1P55194 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms