Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ephb3P54754 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms