Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cux1P53564 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cux1P53564 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms