Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dbx1P52950 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dbx1P52950 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dbx1P52950 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Dbx1P52950 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Dbx1P52950 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dbx1P52950 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms