Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Efnb1P52795 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Efnb1P52795 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efnb1P52795 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Efnb1P52795 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Efnb1P52795 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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