Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LumP51885 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LumP51885 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LumP51885 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LumP51885 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms