Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TspoP50637 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TspoP50637 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TspoP50637 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TspoP50637 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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