Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FmodP50608 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FmodP50608 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FmodP50608 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FmodP50608 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FmodP50608 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FmodP50608 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FmodP50608 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms