Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pa2g4P50580 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms