Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ArsaP50428 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ArsaP50428 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms