Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SftpdP50404 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SftpdP50404 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SftpdP50404 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms